Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf4bG5E8Z2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf4bG5E8Z2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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