Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r58G3X9U3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms