Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Crocc2F6XLV1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Crocc2F6XLV1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms