Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Zfp988F6VKC7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Zfp988F6VKC7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Zfp988F6VKC7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Zfp988F6VKC7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Zfp988F6VKC7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Zfp988F6VKC7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Zfp988F6VKC7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Zfp988F6VKC7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp988F6VKC7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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