Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm28305F6U473 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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