Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf4E9QAP7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf4E9QAP7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms