Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmod3E9QA62 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmod3E9QA62 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms