Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ccdc7bE9Q9Y3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ccdc7bE9Q9Y3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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