Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
ApobE9Q414 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
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