Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gcom1E9PZ54 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcom1E9PZ54 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms