Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Brd1E9PZ26 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms