Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm3298E9PW80 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm3298E9PW80 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm3298E9PW80 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm3298E9PW80 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm3298E9PW80 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm3298E9PW80 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm3298E9PW80 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm3298E9PW80 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm3298E9PW80 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms