Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30bE9PVL6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms