Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc17E9PVB5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms