Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc175E9PVB3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms