Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc170D3YXL0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms