Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smok3bC0HKC9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms