Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cspp1B2RX88 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cspp1B2RX88 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms