Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apba1B2RUJ5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms