Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Brpf1B2RRD7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms