Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uhrf1bp1B2KF50 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms