Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nfx1B1AY10 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms