Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NhsB1AV60 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NhsB1AV60 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms