Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trabd2bB1ATG9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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