Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grik3B1AS29 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms