Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gbp4A4UUI3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gbp4A4UUI3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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