Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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