Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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Atp8b5A3FIN4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Atp8b5A3FIN4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Atp8b5A3FIN4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Atp8b5A3FIN4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b5A3FIN4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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