Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
H2al1jA2BFR3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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