Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pramef6A2A8M8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pramef6A2A8M8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pramef6A2A8M8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pramef6A2A8M8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pramef6A2A8M8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pramef6A2A8M8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pramef6A2A8M8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pramef6A2A8M8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pramef6A2A8M8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Pramef6A2A8M8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Pramef6A2A8M8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Pramef6A2A8M8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramef6A2A8M8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Pramef6A2A8M8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pramef6A2A8M8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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