Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb4A2A863 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Itgb4A2A863 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms