Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

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Length 1,177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Nlrp1bA1Z198 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Nlrp1bA1Z198 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nlrp1bA1Z198 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Nlrp1bA1Z198 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Nlrp1bA1Z198 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Nlrp1bA1Z198 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Nlrp1bA1Z198 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Nlrp1bA1Z198 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Nlrp1bA1Z198 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Nlrp1bA1Z198 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Nlrp1bA1Z198 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nlrp1bA1Z198 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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