Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms