Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
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