Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B694

Trav14-2, T cell receptor alpha variable 14-2 (Fragment), mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav14-2A0A075B694 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Trav14-2A0A075B694 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Trav14-2A0A075B694 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Trav14-2A0A075B694 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Trav14-2A0A075B694 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Trav14-2A0A075B694 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Trav14-2A0A075B694 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Trav14-2A0A075B694 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Trav14-2A0A075B694 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Trav14-2A0A075B694 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trav14-2A0A075B694 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trav14-2A0A075B694 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Trav14-2A0A075B694 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Trav14-2A0A075B694 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trav14-2A0A075B694 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trav14-2A0A075B694 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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