Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3550W4VSN7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms