Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Hdac6Q9Z2V5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Hdac6Q9Z2V5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Hdac6Q9Z2V5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Hdac6Q9Z2V5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Hdac6Q9Z2V5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Hdac6Q9Z2V5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Hdac6Q9Z2V5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Hdac6Q9Z2V5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Hdac6Q9Z2V5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Hdac6Q9Z2V5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Hdac6Q9Z2V5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Hdac6Q9Z2V5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Hdac6Q9Z2V5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdac6Q9Z2V5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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