Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Pdpk1Q9Z2A0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Pdpk1Q9Z2A0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Pdpk1Q9Z2A0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pdpk1Q9Z2A0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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