Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms