Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AireQ9Z0E3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
AireQ9Z0E3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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