Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Snx1Q9WV80 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Snx1Q9WV80 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx1Q9WV80 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms