Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnip1Q9WUU8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms