Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hic1Q9R1Y5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hic1Q9R1Y5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms