Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfwd2Q9R1A8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfwd2Q9R1A8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfwd2Q9R1A8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfwd2Q9R1A8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfwd2Q9R1A8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfwd2Q9R1A8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfwd2Q9R1A8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfwd2Q9R1A8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfwd2Q9R1A8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfwd2Q9R1A8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfwd2Q9R1A8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfwd2Q9R1A8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfwd2Q9R1A8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rfwd2Q9R1A8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rfwd2Q9R1A8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms