Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Clec4eQ9R0Q8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Clec4eQ9R0Q8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Clec4eQ9R0Q8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Clec4eQ9R0Q8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Clec4eQ9R0Q8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms