Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed2Q9R0Q3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed2Q9R0Q3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms