Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gpc6Q9R087 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gpc6Q9R087 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gpc6Q9R087 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gpc6Q9R087 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gpc6Q9R087 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gpc6Q9R087 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gpc6Q9R087 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gpc6Q9R087 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gpc6Q9R087 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gpc6Q9R087 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gpc6Q9R087 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gpc6Q9R087 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gpc6Q9R087 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gpc6Q9R087 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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