Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkab1Q9R078 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms