Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

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Length 1,129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Atp11cQ9QZW0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Atp11cQ9QZW0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp11cQ9QZW0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms