Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 925 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms